（1）杉木、马尾松种子发育的蛋白质组研究

     杉木、马尾松是我国重要的用材树种，有着重要的经济和生态价值。但由于种子短期限制了苗木的供应，体胚发生是获取优质苗木的重要手段，但传统的体胚发生过程冗长而繁琐，基于体细胞胚胎发生重演合子发生进程这一理论基础开展合子胚和包裹合子胚的雌配子体为研究对象试图了解自然状态下合子胚的发育，为通过合子胚发育来指导秘本植物体胚发生提供理论基础。该方面研究内容发表在Journal of ExperimentalBotany（影响因子5.526）和Plant Physiology andBiochemistry（影响因子2.756）杂志上。

（2）鹅掌楸胚性愈伤与非胚性愈伤蛋白质组、磷酸化蛋白质组学研究

     2005年Science杂志的特刊列出125个重要的科学问题，一个体细胞如何成为一棵完整的植株是其中的一个重要的科学问题。体胚发生生理与分子生物学事件的研究是一个非常有趣的科学问题。杂交鹅掌楸是我国著名林木遗传育种专家叶培忠教授利用分布在我国的中国鹅掌楸和分布在北美的北美鹅掌楸通过人工杂交育成的种间杂种,具有重要的经济价值和社会价值。胚性能力的获得是一个复杂的过程，体细胞胚胎发生需要跨越的第一步。基于该科学问题开展了蛋白质组学来研究杂交鹅掌楸一优良基因型的胚性愈伤和非胚性愈伤组织蛋白质组的差异表达及蛋白质翻译后修饰——磷酸化修饰。以期了解细胞重编程后磷酸化信号分子在胚性分子调控、代谢调控网络间的关系，为体胚发生的理论研究和实践操作提供一定的借鉴。这方面的研究内容发表在Acta PhysiologiaePlantarum（影响因子1.584